胃幽門螺旋桿菌據估計全世界約有超過一半的成年人感染過此菌，人們一旦在感染幽門螺旋桿菌後，在臨床上大多數感染者是不具有任何症狀的，只有將近10%的患者會產生慢性胃炎、胃及十二指腸潰瘍，若沒有接受特定抗生素殺菌治療，在持續感染數十年後，可能會增加發生黏膜相關淋巴組織淋巴瘤甚至胃（腺）癌的機會。在1994年幽門螺旋桿菌已被世界衛生組織確定為第一類致癌因子。我國的研究團隊亦證實隨著幽門螺旋桿菌的根除，將使得胃癌的發生率明顯的下降且發表在國際著名的醫學雜誌。
目前台灣醫界遵循的幽門桿菌根除治療的適應症，乃是根據國際第三版馬斯垂克共識會議報告，需要接受治療的狀況在成年人包含: (1)消化性潰瘍(2)胃黏膜相關淋巴組織淋巴癌 (3)萎縮性胃炎(4)胃癌切除後(5)胃癌患者第一級親屬 (6)經充分知會後病人仍有意願(7)非潰瘍性消化不良 (8)須長時間服用非固醇類抗發炎止痛劑 (9)需要長期接受質子幫浦抑制劑 (10)無法解釋的缺鐵性貧血 (11)原因不明的血小板不足紫斑症等。而近幾年台灣的標準三合一療法，包含質子幫浦抑制劑，一顆一日兩次，Amoxicillin 1000 mg一日兩次，Clarithromycin 500 mg一日兩次或Metronidazole 500 mg一日兩次，治療一週除菌的成功率可高達八成以上，而14天之三合一治療比起7天之三合一治療可提高除菌率但卻增加藥物的副作用風險。治療後休息一個月後可考慮接受C13呼氣測試驗證幽門桿菌是否成功除菌。三合一初次治療失敗若失敗，仍有不同組合的四合一治療或是以quinolone類抗生素為主的第二線治療。而台大醫院近幾年的研究更指出，二段式的序列式服藥14天，殺菌更有效，最高達9成，但不適用於復發患者。
雖然台灣地區民眾抗生素的抗藥性嚴重，但經由腸胃科醫師的治療評估，或進一步培養難治病人的細菌然後測試其抗藥性，仍有極高的機會能成功除菌。台灣每年有1%的患者幽門桿菌再度上身，因此建議患者滅菌成功之後，共餐時不妨公筷母匙，朝夕相處的家人也應該檢測是否帶菌或除菌來確保擁有健康人生。
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